Koronavírus eredete: A genomelemzés azt sugallja, hogy két vírus kombinálódhat

Kép keresztül Michal Ico / Unsplash

Alexandre Hassanin ezt a cikkét itt újból közzéteszi A beszélgetés . Ezt a tartalmat azért osztják meg itt, mert a téma érdekelheti a Snopes olvasóit, ugyanakkor nem jelenti a Snopes tényellenőrzőinek vagy szerkesztői munkáját.




Néhány hét leforgása alatt mindannyian sokat tanultunk a COVID-19-ről és az azt okozó vírusról: SARS-CoV-2. De sok pletyka is felmerült. És bár a vírusról szóló tudományos cikkek száma növekszik, eredetét illetően még mindig sok szürke terület van.



Melyik állatfajnál fordult elő? Denevér, pangolin vagy más vad faj? Honnan származik? Barlangból vagy erdőből a kínai Hubei tartományban, vagy másutt?

2019 decemberében az első 41 kórházba került ember közül 27 (66%) áthaladt egy piacon, Wuhan városának szívében, Hubei tartományban. De a a Wuhani Kórházban végzett tanulmány , a legelső emberi eset nem volt gyakori ezen a piacon. Helyette, molekuláris datálás becslés a SARS-CoV-2 genomi szekvenciák alapján novemberi származást jelöl. Ez kérdéseket vet fel a COVID-19 járvány és az élővilág közötti kapcsolatról.



Genomikai adatok

A SARS-CoV-2 genom kínai kutatók gyorsan szekvenálták. Ez egy RNS körülbelül 30 000 bázisú molekula, amely 15 gént tartalmaz, beleértve az S gént, amely a vírusburok felszínén elhelyezkedő fehérjét kódolja (összehasonlításképpen, genomunk DNS dupla spirál formájában van, körülbelül 3 milliárd bázis nagyságú, és tartalmaz körülbelül 30 000 gén).

Összehasonlító genomikai elemzések kimutatták, hogy a SARS-CoV-2 a Betacoronavírusok és hogy nagyon közel van ahhoz SARS-CoV , felelős az akut tüdőgyulladás járványáért, amely 2002 novemberében jelent meg Guangdong kínai tartományában, majd 2003-ban 29 országba terjedt. Összesen 8098 esetet regisztráltak, köztük 774 halálesetet. Ismeretes, hogy a nemzetség deneverei Rhinolophus (potenciálisan több barlangfaj) voltak a vírustározó és hogy egy kis húsevő, a tenyér cibet ( Paguma larvata ) szolgálhatott köztes gazda denevérek és az első emberi esetek között.

Azóta sokan Betacoronavírusok főleg denevéreknél, de embereknél is felfedezték. Például a faj denevérjétől izolált RaTG13 Rhinolophidae rokon a kínai Yunan tartományban gyűjtött, a közelmúltban nagyon hasonlónak írták le a SARS-CoV-2-re, a a genomszekvenciák megegyeznek a 96% -kal . Ezek az eredmények azt mutatják, hogy a denevérek és különösen a nemzetség fajai Rhinolophus képezik a SARS-CoV és a SARS-CoV-2 vírusok tározóját.



Egy, Rhinolophidae rokon .
Alexandre Hasszanin,Szerző megadta

iskolai lövöldözés azóta, hogy Trump hivatalba lépett

De hogyan határozhatja meg a víztározót? A víztározó egy vagy több olyan állatfaj, amely nem vagy nagyon nem érzékeny a vírusra, amely természetesen egy vagy több vírust fog befogadni. A betegség tüneteinek hiányát az immunrendszerük hatékonysága magyarázza, amely lehetővé teszi számukra a túl sok vírusproliferáció elleni küzdelmet.

Rekombinációs mechanizmus

2020. február 7-én megtudtuk, hogy a pangolinban még a SARS-CoV-2-hez közelebb álló vírust fedeztek fel. 99% -ával genomi egyezés jelentve , ez valószínűbb víztározót javasolt, mint a denevérek. Ugyanakkor a nemrégiben vizsgált tanulmány azt mutatja, hogy a malajziai pangolinból izolált koronavírus genomja ( Manis javanica ) kevésbé hasonlít a SARS-Cov-2-re, csupán a genomi egyezés 90% -a. Ez azt jelzi, hogy a pangolinban izolált vírus nem felelős a jelenleg tomboló COVID-19 járványért.

A pangolinból izolált koronavírus azonban 99% -ban hasonló az S fehérje egy meghatározott régiójában, ami megfelel az ACE (Angiotenzin Converting Enzyme 2) receptor kötő doménben részt vevő 74 aminosavnak, amely lehetővé teszi a vírus bejutását emberi sejtek megfertőzni őket. Ezzel szemben a denevérből izolált RaTG13 vírus R. kapcsolatos ebben a sajátos régióban nagyon eltérő (a hasonlóságnak csak 77% -a). Ez azt jelenti, hogy a pangolinból izolált koronavírus képes bejutni az emberi sejtekbe, míg a denevérből izolált R. kapcsolatos nem.

Ezenkívül ezek a genomi összehasonlítások arra utalnak, hogy a SARS-Cov-2 vírus két különböző vírus közötti rekombináció eredménye, az egyik közel az RaTG13-hoz, a másik pedig a pangolin vírushoz. Más szóval, egy már létező vírus kiméra.

A pangolinból származó koronavírus lehet a COVID-19 egyik forrása.
Vadon élő állatok szövetsége / Flickr , CC BY

Ez a rekombinációs mechanizmus megvolt már leírták koronavírusokban, különös tekintettel a SARS-CoV eredetének magyarázatára. Fontos tudni, hogy a rekombináció egy új vírust eredményez, amely potenciálisan képes új gazdanövény megfertőzésére. A rekombináció bekövetkezéséhez a két divergens vírusnak egyszerre kell megfertőznie ugyanazt a szervezetet.

Két kérdés maradt megválaszolatlan: melyik organizmusban fordult elő ez a rekombináció? (denevér, pangolin vagy más faj?) És mindenekelőtt milyen körülmények között zajlott le ez a rekombináció?


Alexandre Hasszanin , Egyetemi docens (HDR) a Sorbonne Egyetemen, ISYEB - Szisztematikai Intézet, Evolúció, Biológiai Sokféleség (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Nemzeti Természettudományi Múzeum (MNHN)

Ezt a cikket újból közzétették A beszélgetés Creative Commons licenc alatt. Olvassa el a eredeti cikk .